据IGN报道，《尼尔：自动人形 Ver1.1a》已决定制作第二季，并公布了第二季预告。西历5012年。突然入侵地球的外星人与其制造的机械生物导致人类面临灭亡危机。仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用人造人士兵展开反攻作战。 然而无限增加的机械生物阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人「寄叶」部队至地球。刚被派往地球的「2B」与先行调查员「9S」会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……
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女主角柚是一位狐狸娘在“此花亭”作为服务生打工居住，此花亭内还有其他作为服务生的狐娘前辈们，而这家温泉旅馆的客人都是各路熟客神仙，只有拥有「票据」的客人才能进入，而狐娘们的热情周到的服务以及狐娘之间的友谊治愈人心。
飞弹伤无（赤羽根健治 配音）表面看来是一个非常平凡的男孩子，在姐姐飞弹怜悧（衣川里佳 配音）的安排下，他进入了战略防卫学园阿塔拉克西亚学习，这里生活的女孩们都拥有着各自的魔导装甲，希望能够通过学习如何操纵它们来成为一名合格的战士。实际上，飞弹伤无拥有着一项特殊能力，那就是通过触摸女孩们的身体来增加她们的装甲的威力。外冷内热嘴硬心软的千鸟渊爱音（影山灯 配音）、热情奔放身材傲人的优莉西亚（赤崎千夏 配音）、风纪委员姬川映流（长妻树里 配音），在学园里，飞弹伤无很快就交到了朋友。
新田义史（中岛良树 配音）是就职于芦川组的黑社会干部，虽然长相非常的凶恶，从事的也是令人闻风丧胆的职业，但实际上，新田义史拥有一颗十分善良的心灵。一天，一个神秘的椭圆形物体掉落到了新田义史的房间里，在那里出现了一个美丽的少女雏（田中贵子 配音）。面无表情的雏向新田义史强大的念动力，迫于雏的淫威，新田义史不得不让她以女儿的身份住进自己的家中，就这样，黑社会人事和超能力少女的同居生活开始了。
